Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nxpe3B9EKK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nxpe3B9EKK6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nxpe3B9EKK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nxpe3B9EKK6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nxpe3B9EKK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms