Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syce3B5KM66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Syce3B5KM66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syce3B5KM66 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms