Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM4EB2RXH2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4EB2RXH2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM4EB2RXH2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM4EB2RXH2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4EB2RXH2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms