Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rd3lB2RV38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rd3lB2RV38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rd3lB2RV38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rd3lB2RV38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms