Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Brpf1B2RRD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Brpf1B2RRD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brpf1B2RRD7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brpf1B2RRD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brpf1B2RRD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brpf1B2RRD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brpf1B2RRD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms