Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap42B2RQE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap42B2RQE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap42B2RQE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap42B2RQE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap42B2RQE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms