Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700011M02RikB1AX35 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
1700011M02RikB1AX35 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700011M02RikB1AX35 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms