Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem238A9JSM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem238A9JSM3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem238A9JSM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms