Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF99A8MXY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF99A8MXY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF99A8MXY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF99A8MXY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF99A8MXY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF99A8MXY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF99A8MXY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms