Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM23A6NLE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM23A6NLE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM23A6NLE4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM23A6NLE4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM23A6NLE4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMIM23A6NLE4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMIM23A6NLE4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms