Protein–RNA interactions for Protein: A6NIZ1

Ras-related protein Rap-1b-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NIZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NIZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NIZ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NIZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NIZ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NIZ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NIZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NIZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NIZ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NIZ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NIZ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NIZ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NIZ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NIZ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NIZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NIZ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NIZ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NIZ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NIZ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NIZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NIZ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NIZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NIZ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NIZ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NIZ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NIZ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NIZ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NIZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NIZ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NIZ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NIZ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NIZ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NIZ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NIZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A6NIZ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NIZ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NIZ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NIZ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NIZ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NIZ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NIZ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NIZ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NIZ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NIZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NIZ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NIZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NIZ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NIZ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NIZ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NIZ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NIZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NIZ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A6NIZ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NIZ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NIZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NIZ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NIZ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NIZ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NIZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NIZ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NIZ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NIZ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NIZ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NIZ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NIZ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NIZ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NIZ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NIZ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NIZ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NIZ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NIZ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NIZ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NIZ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NIZ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NIZ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NIZ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NIZ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NIZ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms