Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC182A6NF36 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC182A6NF36 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC182A6NF36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms