Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L9A6NEM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L9A6NEM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L9A6NEM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms