Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPN1LA6NDY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPN1LA6NDY0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPN1LA6NDY0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPN1LA6NDY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms