Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL33A6NCF5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL33A6NCF5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms