Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp8b5A3FIN4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b5A3FIN4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b5A3FIN4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8b5A3FIN4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp8b5A3FIN4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms