Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc43a3A2AVZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc43a3A2AVZ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc43a3A2AVZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc43a3A2AVZ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc43a3A2AVZ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms