Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn3aA2ASI5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn3aA2ASI5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scn3aA2ASI5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn3aA2ASI5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn3aA2ASI5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn3aA2ASI5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms