Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga8A2ARA8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga8A2ARA8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga8A2ARA8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga8A2ARA8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms