Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn1aA2APX8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn1aA2APX8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn1aA2APX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn1aA2APX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn1aA2APX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scn1aA2APX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn1aA2APX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn1aA2APX8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn1aA2APX8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn1aA2APX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms