Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm884A2A9H6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm884A2A9H6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm884A2A9H6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm884A2A9H6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm884A2A9H6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms