Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Prdm2A2A7B5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Prdm2A2A7B5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Prdm2A2A7B5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prdm2A2A7B5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prdm2A2A7B5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Prdm2A2A7B5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Prdm2A2A7B5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms