Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl2cA2A6C4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl2cA2A6C4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl2cA2A6C4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl2cA2A6C4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl2cA2A6C4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sppl2cA2A6C4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sppl2cA2A6C4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sppl2cA2A6C4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sppl2cA2A6C4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sppl2cA2A6C4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sppl2cA2A6C4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sppl2cA2A6C4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sppl2cA2A6C4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms