Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCE3A1L190 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCE3A1L190 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCE3A1L190 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCE3A1L190 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms