Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRGMA1A4Y4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRGMA1A4Y4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGMA1A4Y4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms