Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd3A0A140LIW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Frmpd3A0A140LIW3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmpd3A0A140LIW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmpd3A0A140LIW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd3A0A140LIW3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd3A0A140LIW3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms