Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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