Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A0A0J9YXV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
A0A0J9YXV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A0A0J9YXV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms