Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WXM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A087WXM4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WXM4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WXM4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms