Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B619

Trav14d-3-dv8, MCG142750 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14d-3-dv8A0A075B619 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms