Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms