Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTA9

Eif4e1b, Eukaryotic translation initiation factor 4E type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4e1bQ3UTA9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eif4e1bQ3UTA9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif4e1bQ3UTA9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms