Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms