Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kif3aP28741 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms