Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prf1P10820 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prf1P10820 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms