Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme1P97371 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms