Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ssxb10Q6XAR7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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