Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prf1P10820 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms