Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01666 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01666 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01666 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01666 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01666 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01666 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01666 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01666 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01666 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms