Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f6O54917 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms