Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms