Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Rabgef1Q9JM13 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
Rabgef1Q9JM13 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Rabgef1Q9JM13 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Rabgef1Q9JM13 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
Rabgef1Q9JM13 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
Rabgef1Q9JM13 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
Rabgef1Q9JM13 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
Rabgef1Q9JM13 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
Rabgef1Q9JM13 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
Rabgef1Q9JM13 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Rabgef1Q9JM13 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Rabgef1Q9JM13 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
Rabgef1Q9JM13 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
Rabgef1Q9JM13 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Rabgef1Q9JM13 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Rabgef1Q9JM13 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Rabgef1Q9JM13 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
Rabgef1Q9JM13 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Rabgef1Q9JM13 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
Rabgef1Q9JM13 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Rabgef1Q9JM13 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
Rabgef1Q9JM13 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Rabgef1Q9JM13 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Rabgef1Q9JM13 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
Rabgef1Q9JM13 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms