Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Ccl20O89093 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
Ccl20O89093 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
Ccl20O89093 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
Ccl20O89093 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
Ccl20O89093 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
Ccl20O89093 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
Ccl20O89093 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
Ccl20O89093 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
Ccl20O89093 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
Ccl20O89093 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
Ccl20O89093 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
Ccl20O89093 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
Ccl20O89093 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Ccl20O89093 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Ccl20O89093 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Ccl20O89093 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Ccl20O89093 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
Ccl20O89093 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccl20O89093 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Ccl20O89093 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Ccl20O89093 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
Ccl20O89093 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
Ccl20O89093 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccl20O89093 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Ccl20O89093 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Ccl20O89093 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Ccl20O89093 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Ccl20O89093 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
Ccl20O89093 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
Ccl20O89093 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
Ccl20O89093 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms