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Protein–RNA interactions for Protein: Q62267
Sprr1b, Cornifin-B, mouse
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153 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Sprr1b
Q62267
Gm24387-201
ENSMUST00000104625
90 nt
BASIC
-4.46
□□□□□ -3.12
Sprr1b
Q62267
Gm44322-201
ENSMUST00000196830
115 nt
BASIC
-4.47
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm22621-201
ENSMUST00000179678
74 nt
BASIC
-4.5
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm23678-201
ENSMUST00000083157
107 nt
BASIC
-4.5
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm22258-201
ENSMUST00000177645
94 nt
BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm26032-201
ENSMUST00000178535
94 nt
BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm25210-201
ENSMUST00000178813
94 nt
BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm25157-201
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94 nt
BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm22046-201
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BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm22941-201
ENSMUST00000179630
94 nt
BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm25471-201
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94 nt
BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Mir669a-3-201
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109 nt
BASIC
-4.52
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
mt-Atp8-201
ENSMUST00000082407
204 nt
APPRIS P1
BASIC
-4.53
□□□□□ -3.13
Sprr1b
Q62267
Gm28925-201
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168 nt
BASIC
-4.54
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm28724-201
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625 nt
BASIC
-4.55
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Mir7681-201
ENSMUST00000184834
72 nt
BASIC
-4.57
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm25380-201
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BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm24641-201
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BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm25484-201
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107 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm26138-201
ENSMUST00000179236
107 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm22821-201
ENSMUST00000179288
107 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm23298-201
ENSMUST00000083181
107 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm25516-201
ENSMUST00000083857
107 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm25521-201
ENSMUST00000158393
108 nt
BASIC
-4.59
□□□□□ -3.14
Sprr1b
Q62267
Gm23785-201
ENSMUST00000116741
96 nt
BASIC
-4.6
□□□□□ -3.15
Sprr1b
Q62267
Gm22474-201
ENSMUST00000179407
107 nt
BASIC
-4.6
□□□□□ -3.15
Sprr1b
Q62267
Gm26227-201
ENSMUST00000082510
101 nt
BASIC
-4.6
□□□□□ -3.15
Sprr1b
Q62267
n-R5s214-201
ENSMUST00000122494
121 nt
BASIC
-4.61
□□□□□ -3.15
Sprr1b
Q62267
Gm24001-201
ENSMUST00000158463
85 nt
BASIC
-4.63
□□□□□ -3.15
Sprr1b
Q62267
Gm22078-201
ENSMUST00000157593
103 nt
BASIC
-4.67
□□□□□ -3.16
Sprr1b
Q62267
Gm23644-201
ENSMUST00000157856
77 nt
BASIC
-4.67
□□□□□ -3.16
Sprr1b
Q62267
Gm22213-201
ENSMUST00000157564
119 nt
BASIC
-4.69
□□□□□ -3.16
Sprr1b
Q62267
Gm24234-201
ENSMUST00000104316
107 nt
BASIC
-4.72
□□□□□ -3.17
Sprr1b
Q62267
Gm24410-201
ENSMUST00000083433
107 nt
BASIC
-4.73
□□□□□ -3.17
Sprr1b
Q62267
Gm25254-201
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104 nt
BASIC
-4.76
□□□□□ -3.17
Sprr1b
Q62267
Gm17490-201
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63 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-4.76
□□□□□ -3.17
Sprr1b
Q62267
AC161426.1-201
ENSMUST00000214137
286 nt
BASIC
-4.77
□□□□□ -3.17
Sprr1b
Q62267
Gm23293-201
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104 nt
BASIC
-4.79
□□□□□ -3.18
Sprr1b
Q62267
Gm22301-201
ENSMUST00000082656
107 nt
BASIC
-4.81
□□□□□ -3.18
Sprr1b
Q62267
Gm24676-201
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75 nt
BASIC
-4.84
□□□□□ -3.18
Sprr1b
Q62267
Gm22127-201
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BASIC
-4.85
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm23961-201
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BASIC
-4.86
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm22709-201
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BASIC
-4.86
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm22550-201
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BASIC
-4.86
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm22060-201
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107 nt
BASIC
-4.86
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm44303-201
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BASIC
-4.87
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm25039-201
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107 nt
BASIC
-4.87
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
mt-Tl2-201
ENSMUST00000082417
71 nt
BASIC
-4.89
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Gm23652-201
ENSMUST00000116752
107 nt
BASIC
-4.9
□□□□□ -3.19
Sprr1b
Q62267
Snord50a-201
ENSMUST00000178154
72 nt
BASIC
-4.91
□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Gm24463-201
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BASIC
-4.91
□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Gm22251-201
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BASIC
-4.91
□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Mir450b-201
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BASIC
-4.93
□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Mir669m-2-201
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BASIC
-4.93
□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Gm25401-201
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BASIC
-4.93
□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Gm24194-201
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BASIC
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□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Rnu6-ps2-201
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BASIC
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□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Gm23970-201
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BASIC
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□□□□□ -3.2
Sprr1b
Q62267
Gm22679-201
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BASIC
-4.97
□□□□□ -3.21
Sprr1b
Q62267
Gm22845-201
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104 nt
BASIC
-4.97
□□□□□ -3.21
Sprr1b
Q62267
Gm25382-201
ENSMUST00000157811
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BASIC
-4.98
□□□□□ -3.21
Sprr1b
Q62267
Gm24835-201
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111 nt
BASIC
-4.99
□□□□□ -3.21
Sprr1b
Q62267
Gm26092-201
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BASIC
-5.05
□□□□□ -3.22
Sprr1b
Q62267
Mir669a-1-201
ENSMUST00000180238
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BASIC
-5.05
□□□□□ -3.22
Sprr1b
Q62267
Gm23038-201
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BASIC
-5.05
□□□□□ -3.22
Sprr1b
Q62267
Gm24167-201
ENSMUST00000177733
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BASIC
-5.06
□□□□□ -3.22
Sprr1b
Q62267
Gm24028-201
ENSMUST00000178991
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BASIC
-5.06
□□□□□ -3.22
Sprr1b
Q62267
Gm23966-201
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107 nt
BASIC
-5.11
□□□□□ -3.23
Sprr1b
Q62267
Gm20734-201
ENSMUST00000216939
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BASIC
-5.11
□□□□□ -3.23
Sprr1b
Q62267
Gm25524-201
ENSMUST00000101821
107 nt
BASIC
-5.12
□□□□□ -3.23
Sprr1b
Q62267
Traj42-201
ENSMUST00000103700
64 nt
APPRIS P1
BASIC
-5.12
□□□□□ -3.23
Sprr1b
Q62267
Gm22911-201
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107 nt
BASIC
-5.15
□□□□□ -3.23
Sprr1b
Q62267
Gm25132-201
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107 nt
BASIC
-5.15
□□□□□ -3.23
Sprr1b
Q62267
Gm23350-201
ENSMUST00000158429
103 nt
BASIC
-5.17
□□□□□ -3.24
Sprr1b
Q62267
Gm25987-201
ENSMUST00000083234
107 nt
BASIC
-5.17
□□□□□ -3.24
Sprr1b
Q62267
Gm23852-201
ENSMUST00000158376
77 nt
BASIC
-5.18
□□□□□ -3.24
Sprr1b
Q62267
Gm22950-201
ENSMUST00000082776
107 nt
BASIC
-5.19
□□□□□ -3.24
Sprr1b
Q62267
Gm24605-201
ENSMUST00000104772
96 nt
BASIC
-5.26
□□□□□ -3.25
Sprr1b
Q62267
Gm23578-201
ENSMUST00000103943
104 nt
BASIC
-5.3
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir6481-201
ENSMUST00000184617
110 nt
BASIC
-5.31
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Gm24148-201
ENSMUST00000082762
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BASIC
-5.31
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Gm25022-201
ENSMUST00000102205
83 nt
BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-6-201
ENSMUST00000177790
83 nt
BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-3-201
ENSMUST00000178082
83 nt
BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-7-201
ENSMUST00000178635
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BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-10-201
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83 nt
BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-5-201
ENSMUST00000179352
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BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-2-201
ENSMUST00000179447
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BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-9-201
ENSMUST00000179752
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BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-4-201
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BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir467a-8-201
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BASIC
-5.32
□□□□□ -3.26
Sprr1b
Q62267
Mir34c-201
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77 nt
BASIC
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□□□□□ -3.27
Sprr1b
Q62267
Gm24396-201
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93 nt
BASIC
-5.39
□□□□□ -3.27
Sprr1b
Q62267
Gm25815-201
ENSMUST00000082755
107 nt
BASIC
-5.39
□□□□□ -3.27
Sprr1b
Q62267
mt-Td-201
ENSMUST00000082404
70 nt
BASIC
-5.41
□□□□□ -3.28
Sprr1b
Q62267
Gm26259-201
ENSMUST00000104778
97 nt
BASIC
-5.42
□□□□□ -3.28
Sprr1b
Q62267
Gm25049-201
ENSMUST00000158597
73 nt
BASIC
-5.46
□□□□□ -3.28
Sprr1b
Q62267
Gm25315-201
ENSMUST00000116823
121 nt
BASIC
-5.5
□□□□□ -3.29
Sprr1b
Q62267
Gm23248-201
ENSMUST00000083367
108 nt
BASIC
-5.5
□□□□□ -3.29
Sprr1b
Q62267
Mir466l-201
ENSMUST00000104866
121 nt
BASIC
-5.52
□□□□□ -3.29
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