Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Trim71Q1PSW8 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Trim71Q1PSW8 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Gm26122-201ENSMUST00000083362 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir466o-201ENSMUST00000104832 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Trim71Q1PSW8 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir485-201ENSMUST00000093620 73 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir470-201ENSMUST00000093565 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Trim71Q1PSW8 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Trim71Q1PSW8 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trim71Q1PSW8 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm23707-201ENSMUST00000104366 125 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trim71Q1PSW8 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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