Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Traf3ip1Q149C2 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Traf3ip1Q149C2 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Traf3ip1Q149C2 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm23315-201ENSMUST00000158003 109 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Traf3ip1Q149C2 Gm24502-201ENSMUST00000158453 105 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Traf3ip1Q149C2 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
Traf3ip1Q149C2 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Traf3ip1Q149C2 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Traf3ip1Q149C2 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Traf3ip1Q149C2 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
Traf3ip1Q149C2 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
Traf3ip1Q149C2 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Traf3ip1Q149C2 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms