Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps3aP97351 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Rps3aP97351 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Rps3aP97351 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Rps3aP97351 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
Rps3aP97351 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Rps3aP97351 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Rps3aP97351 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Rps3aP97351 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Rps3aP97351 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
Rps3aP97351 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Rps3aP97351 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Rps3aP97351 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
Rps3aP97351 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
Rps3aP97351 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Rps3aP97351 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Rps3aP97351 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Rps3aP97351 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Rps3aP97351 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.59□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.59□□□□□ -2.66
Rps3aP97351 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Rps3aP97351 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Rps3aP97351 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Rps3aP97351 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Rps3aP97351 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Rps3aP97351 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Rps3aP97351 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Rps3aP97351 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Rps3aP97351 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Rps3aP97351 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Rps3aP97351 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms