Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Rnft1Q9DCN7 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rnft1Q9DCN7 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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Rnft1Q9DCN7 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rnft1Q9DCN7 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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Rnft1Q9DCN7 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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Rnft1Q9DCN7 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rnft1Q9DCN7 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rnft1Q9DCN7 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rnft1Q9DCN7 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rnft1Q9DCN7 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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Rnft1Q9DCN7 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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Rnft1Q9DCN7 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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Rnft1Q9DCN7 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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Rnft1Q9DCN7 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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Rnft1Q9DCN7 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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