Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc39Q9D5Y1 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms