Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ctu1Q99J10 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ctu1Q99J10 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ctu1Q99J10 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ctu1Q99J10 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms